德孚医药出版社在糖尿病、代谢综合征和肥胖征:靶标和治疗期刊发表了最新文章急性胰腺炎和高甘油三酯血症中枢纽基因的鉴定和验证。
内容摘要背景:
急性胰腺炎(Acutepancreatitis,AP)的发病机制和急性胰腺炎与高甘油三酯血症(Hypertriglyceridemia,HTG)之间的关系是复杂的,尚未得到完全了解。本研究的目的是确定AP和HTG之间的核心基因和共同差异表达基因(DifferentialExpressedGenes,DEGs)。
方法:
从GEO(GeneExpressionOmnibus)数据库中下载AP的3个基因表达谱和HTG的1个基因表达谱,并根据上述4个数据集筛选DEGs。通过基因本体论(GeneOntology,GO)术语分析、京都基因与基因组百科全书(KyotoEncyclopediaofgenesandGenomes,KEGG)通路富集分析和蛋白质-蛋白质互作网络(Protein-proteinInteraction,PPI)构建,确定了核心基因。我们还构建了miRNA-hubgene网络,并分别通过高脂饮食和Caerulein注射建立了HTG和AP小鼠模型。最后,通过免疫组化分析验证核心基因在AP、HTG和正常胰腺组织之间的差异表达。
结果:
共鉴定出个与AP相关的DEGs和个与HTG相关的DEGs。此外,我们还鉴定了AP的6个核心基因,这些基因都与细胞骨架密切相关,而AP和HTG之间有2个共同DEGs。我们还在小鼠模型中验证了它们的表达。最后,我们构建了miRNA-gene网络,并鉴定出了调控多个核心基因的7个miRNAs(hsa-mir-1-3p、hsa-mir--3p、hsa-mir--5p、hsa-let-7b-5p、hsa-mir-10b-5p、hsa-mir-和hsa-mir-)。
结论:
总的来说,我们发现6个AP相关的核心基因、两个AP与HTG的共同DEGs以及7个可能调控多个核心基因的7个miRNAs。这项研究可以为进一步阐明高甘油三酯血症性急性胰腺炎的发病机制提供新的思路。
Keywords:
acutepancreatitis,biomarkers,hypertriglyceridemia-inducedpancreatitis,bioinformatics
点击“阅读原文”,查看英文全文。本刊相关文章阅读老年糖尿病患者代谢综合征与外周动脉疾病的相关性分析
中国正常体重指数中老年人腹型肥胖患病率及其与2型糖尿病发病的相关性:-年全国代表性队列研究
徳孚摘要视频
运用扫描式持续血糖监测系统评估利拉鲁肽在2型糖尿病人群的治疗效果